Le combattant de MMA Cole Young, habitué à se battre pour l'argent, ne connaît ni son héritage, ni pourquoi l'empereur de l'Outre-monde Shang Tsung a envoyé son meilleur guerrier, le mystérieux cryomancien Sub-Zero, à ses trousses. Craignant pour sa famille, Cole part à la recherche de Sonya Blade sur les conseils de Jax, un commandant des Forces Spéciales marqué du même symbole de dragon que Cole possède depuis sa naissance. Il se rend au temple de Lord Raiden, un dieu ancien et protecteur de la Terre proposant sanctuaire aux porteurs de la marque. Cole s'y entraîne aux côtés des vétérans Liu Kang, Kung Lao et du mercenaire Kano afin d'être prêt à affronter ses ennemis de l'Outre-monde aux côtés des plus grands champions de la Terre dans une bataille décidant du sort de l'univers. Mais Cole parviendra-t-il à libérer l'arcane, cet immense pouvoir qui réside en lui, afin de sauver sa famille et arrêter l'Outre-monde pour de bon ?