Den tredje delen av Spielbergs och Lucas älskade saga, Indiana Jones, visar en yngre Indy (spelad av den numera avlidne River Phoenix) som genom en prolog i snabbt tempo berättar för publiken om sin smak för äventyr, ormskräck och envisa beslutsamhet att rädda historiska föremål ur skurkarnas händer och återföra dem till museerna där de hör hemma. Kort därefter dyker en vuxen Indy (Harrison Ford) upp i en bekant klassrumsscen där han lär naiva kvinnliga studenter arkeologi år 1938. Än en gång får mr Jones lämna sitt jobb efter att en konstsamlare (Julian Glover) kontaktar honom för att hitta den eftertraktade heliga graalen. Det avslöjas att det finns ännu en entusiastisk arkeolog som är på jakt efter den berömda graalen, Indiana Jones far, dr Henry Jones (Sean Connery), som nyligen försvunnit under jakten. Far och son hamnar i en rad tuffa situationer i miljöer som Venedig och Mellanöstern. Elsas (Alison Doody) närvaro komplicerar situationen ytterligare. Hon är en vacker och intelligent kvinna med en livsfarlig hemlighet: hon är en hemlig nazistagent. Jakten på graalen är ett farligt uppdrag. De som är ute efter den för egen personlig vinning riskerar att dö när de hittar den. Indiana Jones and the Last Crusade spelade in rekordsumman 50 miljoner dollar under första veckan.