Nu de IMF (Impossible Mission Force) opgeheven is, en Ethan (Tom Cruise) buitengesloten, moet het team het nu opnemen tegen een netwerk van goed opgeleide special agents, 'the Syndicate'. Deze goed getrainde agenten streven een nieuwe wereldorde te creëren door een escalerende reeks terroristische aanslagen te plegen. Ethan roept zijn team bijeen en gaat een alliantie aan met de afgedankte Britse agente Ilsa Faust (Rebecca Ferguson), die mogelijk lid is van deze schurkennatie. De groep begint aan hun meest onmogelijke missie ooit.