I tretten ekstraordinære dager i oktober 1962 sto verden på randen av en utenkelig katastrofe. Over hele verden ventet folk spent på utfallet av en opprivende politisk, diplomatisk og militær konfrontasjon som truet med å ende i en apokalyptisk atomkrig mellom USA og Sovjetunionen. I Thirteen Days er makten og faren for den amerikanske presidenten dramatisk formidlet av regissør Roger Donaldson, som fanger situasjonen, spenningen og det lammende kaoset Cubakrisen skapte. Den alarmerende opptrappingen av hendelsene i løpet av de skjebnesvangre dagene satte virkelig president John F. Kennedy og hans bror Bobby i søkelyset, og det er gjennom øynene til en pålitelig presidentassistent og fortrolig, Kenneth P. O'Donnel at historien utspiller seg.