Les Little Pony s'apprêtent à vivre leur plus belle aventure au cinéma. Quand le roi Storm envahit Canterlot pour voler la magie d’Equestria, les Little Pony doivent chercher du secours au-delà des frontières du royaume… C’est le début d’un fabuleux voyage plein d’action et de découvertes, à travers des montagnes magiques et des mondes sous-marins… et même dans un flamboyant bateau pirate volant !