Una "cura" de la mutación amenaza con alterar el curso de la historia. Por primera vez, los mutantes se enfrentan a una elección: conservar lo que les hace únicos, a pesar de que les aísla y aparta de los demás, o renunciar a sus poderes y convertirse en humanos. Los puntos de vista opuestos de los líderes mutantes Charles Xavier, que pide tolerancia, y Magneto, que cree en la supervivencia del más fuerte, se someten a una última prueba que pondrá en marcha la última de todas las guerras.