Las dos reinas explora la turbulenta vida de la carismática Mary Stuart. Reina de Francia a los 16 y viuda a los 18 años, Mary desafía la presión de volver a casarse y en cambio vuelve a su Escocia natal para recuperar su legítimo trono. Por nacimiento tiene también una rival que reivindica el trono de Elizabeth I, quien funge como Reina de Inglaterra. Decidida a reinar mucho más allá que como una mera figura representante, Mary reivindica su derecho al trono inglés, amenazando así la soberanía de Elisabeth. Rivales en el poder y en el amor, las dos reinas toman decisiones muy distintas respecto al matrimonio y los hijos. Traición, rebelión y conspiraciones dentro de cada corte ponen en peligro la vida de ambas reinas y hace que se separen al experimentar el precio amargo del poder.