Una espesa niebla cubre la costa. Repentinamente, como si saliera de un sueño de terror primitivo, la forma de un enorme reptil oscurece la ventana de un solitario faro. Tiene dientes afilados en una gigantesca boca; garras que pueden cortar a través de acero; un rugido que hace eco a través de los siglos; aletas dorsales que se asemejan a relámpagos carmesí; y aliento ardiente que incinera todo lo que toca. Pronto, todo en la estela de la criatura es totalmente destruido, y un aterrorizado Japón se pregunta dónde aparecerá otra vez esta monstruosa bestia. Godzilla, el rey de los monstruos, ha regresado. Esta vez enfrenta a un nuevo y formidable enemigo, Orga (también conocido como Giant Alien Millennian), una criatura gigantesca y letal que ha transmutado lentamente de un OVNI que se cree que ha estado inactivo durante 6,000 años.