Kongens Nej handler om de tre dramatiske døgn i april 1940, hvor den norske konge får et ufatteligt ultimatum af den tyske krigsmagt: overgivelse eller døden. Med tyske fly og soldater i hælene tvinges kongefamilien på flugt. De bestemmer sig for at skilles uden at vide, om de nogensinde vil se hinanden igen. Kronprinsesse Märtha rejser med børnene til Sverige, mens kong Haakon og kronprins Olav bliver i Norge for at fortsætte kampen. Efter tre døgns desperat flugt træffer kong Haakon sin endelige beslutning. Han nægter at kapitulere, selv om det kan koste både ham selv, hans familie og mange uskyldige nordmænd livet.