Scarlett Johansson er stjernen i den flotte Ghost in the Shell, et action-eventyr, der foregår i en fremtid, hvor folk styrkes med teknologi. Major (Johansson), der tror, hun blev reddet fra døden, bliver den første af sin slags: et menneske inden i en kunstig krop, hvis formål er at bekæmpe cyber-kriminalitet. Da Major efterforsker en farlig kriminel, gør hun en chokerende opdagelse - den virksomhed, der skabte hende, løj om fortiden for at kontrollere hende. I tvivl om, hvad hun skal tro, opklarer Major mysteriet om sin sande identitet og udøver hævn over den virksomhed, hun blev skabt til at tjene.