NCIS　ネイビー犯罪捜査班(字幕版)

D.C.で車が爆発し、中佐が死亡する事故が発生。NCISのチームが捜査を進めると、6ヵ月前にアルゼンチンでの潜入中に失踪したNCISの特別捜査官ニコラス・“ニック”・トーレス（ウィルマー・バルデラマ）と何らかの関わりがあるとみられた

NCISがクアンティコの同窓会で起きた死亡事件を捜査すると、爆破計画と長年活動する窃盗団の存在が浮上。トーレスとクインは、ギブスのチームにも慣れ始める。オフィスでは席替えが行われる。

海兵隊軍曹がビルから転落。彼女を診ていた精神科医のグレイス・コンファローン（ローラ・サン・ジャコモ）は、殺人の線で捜査するようギブスに提言する。トーレスは新しい住まいを探す。

駆逐艦で海軍大尉の遺体が発見される。招待された民間人も同乗できるタイガークルーズの最中だった。ギブスは捜査のために、クインとパーマーと共に乗艦する。

MI6捜査官のクレイトン･リーヴス（デュアン・ヘンリー）は、失踪した同僚を捜すうちに水兵の遺体を発見し、ギブスに協力を依頼。クインとビショップがフィラデルフィアへ送られる。そんな中、クインはNCISの現場を離れることになったある事件について苦しげに打ち明ける。

誘拐されていた女性下士官が犯人の元から脱出。彼女の夫は行方不明となり、NCISが関連を捜査する。アビーはチームの新たな仲間にプレゼントをするため編み物をしていた。

NCISの捜査の中で、トーレスは逃走していた目撃者の身柄を引き取る。事情を聞いて同情したトーレスは、移民局が彼を捜していることを知るが引き渡さない。トニーが住んでいたアパートを借りたいアビーとビショップとマクギーは、彼の父親でアパートを管理するトニー・ディノッゾ・シニア（ロバート・ワグナー）に猛アピールする。

ビショップは、従軍聖職者が殺害された事件の証拠を集めるためにグアンタナモへ行く。そこで彼女は、以前自分がやっていたNSAの仕事に疑問を抱く。

NCISのチームは、ジェナ･フレミング議員（メアリー・スチュアート・マスターソン）に対して続く脅迫事件を調べる。ヴァンス局長は一時的保護の様子を監視する。

NCISのチームが大佐殺害事件の証拠をたどっていくと、ダッキーの亡き母にたどり着き、ダッキーは、37年前に下した人生を変える決断について振り返る。チームのみんなでクリスマスの贈り物をし合い、ギブスはフォーネルと夕食を共にする。

テロを使って株式市場を操作していた実業家を逮捕するための潜入がバレて、NCISは新たな手がかりを探す。ビショップとカシーム（ラフィ・シルヴァー）は行き詰まった捜査を一緒に打開していく。

ギブスはかつてNCISが全力で追っていた容疑者の弟を見かけ、当時の偽名を使って悪名高い反政府組織に潜入する。一方、ビショップはリーヴスの協力を得て非公式な調査をする。

NCISがひき逃げ事件を捜査する一方、パーマーは、ビルから飛び降りようとする見ず知らずの男を助けようとする。

D.C.の外れにある小さな町で下士官殺害事件が起こり、NCISは“シャーロック推理研究会”との合同捜査に踏み切る。研究会にはアンソニー・ディノッゾ・シニア（ロバート・ワグナー）が加わっていた。

国土安全保障省の組織によるシミュレーションに参加したアビーが、本物の爆弾を持ち込んでいたことが判明。NCISのチームが捜査すると、組織のリーダーが殺され、テロ攻撃の戦略マニュアルが盗み出されていたことが分かる。

ギブスたちがチェンについての新たな手がかりを見つけると、ビショップは恋人だったカシームの仇を取ろうと心に決める。トーレスはスリのやり方を説く。

マクギーのアパートの部屋が不法侵入者に荒らされる。侵入者は、現在は服役中の犯罪者が以前その部屋を使っていた時に隠したブツを捜していた。

水兵の思いを果たすため、ギブスたちは事故死と判断された案件を殺人事件として再調査する。トーレスは過去のつらい経験を思い出すこととなる。

退役軍人を無料で招待し、第二次世界大戦、朝鮮戦争、ベトナム戦争の記念碑に案内する非営利団体“オナー･フライト”のイベント中に海兵隊員が殺される。NCISのチームは、ベトナム帰還兵で気が短いヘンリー・ロジャース（ブルース・マッギル）から、その日の被害者の動きを詳細に聞き出す。

海軍中将のパソコンが新種のランサムウェアに感染。ウイルスによってデータが消去される前にマクギーらNCISのチームがハッカーを見つけ出そうとする。

ある海兵の殺害事件が、以前トーレスが1年間潜入していたギャングと結び付き、トーレスは当時の記録と縁故をたどる。

国立公園で海兵隊員の遺体が発見され、ギブスたちは、騎馬警察のメイ・ドーソン（エリザベス・ローム）と協力して公園内で行われていた犯罪を紐解いていく。

結婚式を目前にストレスがたまるマクギーとデライラ（マーゴ・ハーシュマン）だが、思わぬアクシデントに見舞われデライラが病院に駆け込むことに。一方、若く健康だった駆逐艦の下士官が寝ている間に突然死を遂げ、NCISのチームが乗艦する。

ギブスとマクギー、トーレスは、禁止された渡航中に姿を消したSEAL隊員を捜すため、反政府組織下にあるパラグアイの僻地へ赴く。