Kolmentoista poikkeuksellisen päivän ajan lokakuussa 1962 maailma oli kammottavan katastrofin partaalla. Joka puolella maailmaa ihmiset odottivat levottomina poliittisen, diplomaattisen ja sotilaallisen selkkauksen lopputulosta, joka uhkasi päättyä apokalyptiseen ydinaseiskuun USA:n ja Neuvostoliiton välillä. Elokuvassa Kolmetoista päivää USA:n presidentinviran valtaa ja vaaroja tutkii ohjaaja Roger Donaldson, joka ikuistaa Kuuban ohjuskriisin kiireellisyyden, jännityksen ja lamaannuttavan kaaoksen. Noiden kohtalokkaiden päivien huolestuttava tapahtumaketju toi presidentti John F. Kennedyn ja hänen Bobby-veljensä eturiviin, ja tarina kerrotaan presidentin luottoavustajan ja uskotun, Kenneth. P. O'Donnelin näkökulmasta.