Nas Ilhas Laranja ao sul de Kanto, um Treinador chamado Lawrence segue numa busca sinistra: capturar os Pokémon Lendários Articuno, Zapdos e Moltres na tentativa de despertar Lugia, guardião do mar! Quando Ash e seus amigos chegam, os ilhéus pedem que ele junte três orbes elementais de diferentes ilhas. Conforme o clima ao redor do mundo foge do controle, se torna claro que a captura do trio lendário desequilibrou todo o meio-ambiente! Com a ajuda de Lugia, poderá Ash encontrar os orbes, restaurar o equilíbrio e ser o “escolhido” a quem todos se voltaram?