Au XVème siècle, dans l'ancienne Tallinn, le jeune apothicaire Melchior est connu pour son esprit éclairé et son ingéniosité. Après le meurtre sauvage d’un haut responsable de l'Ordre des chevaliers teutoniques retrouvé décapité, le commandant de la garnison lui confie la tâche de débusquer l’assassin. Sans lien apparent, le prieur du monastère meurt empoisonné quelques jours plus tard. Alors que le mystère s’épaissit, Melchior est encore loin de soupçonner que son enquête va le mener sur la trace d'un des secrets les mieux gardés de l'église catholique.