Zeitreise
Staffel 1, Folge 1 FSK16
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27 Jahre, nachdem ein Virus den größten Teil der Menschheit ausgelöscht hat, schicken Wissenschaftler einen Mann, James Cole, zurück ins Jahr 2015. Er soll verhindern, dass die Seuche jemals zum Ausbruch kommt. Coles einziger Anhaltspunkt ist die Virologin Dr. Cassandra Railly, die die gefährlichen Keime kennt.
Patientin 248
Staffel 1, Folge 2 FSK16
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Cole ist auf der Spur der mysteriösen Geheimorganisation „Armee der 12 Monkeys“. Sie führt ihn in eine Nervenheilanstalt des Jahres 2015. Dort hält ein Patient den Schlüssel zur Pandemie in der Hand, die die Menschheit vernichten soll. Trotz der Warnungen, dass ihr Engagement den Verlauf der Geschichte verändern könnte, riskiert Dr. Railly ihr Leben, um Cole zu helfen.
Cassandra Komplex
Staffel 1, Folge 3 FSK16
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Die Suche nach der Quelle des Virus führt Cole ins Jahr 2014. Damals gab es auf Haiti einen gefährlichen Ausbruch, der sich verheerend auf das Leben von Dr. Railly auswirkte.
Halluzinationen
Staffel 1, Folge 4 FSK16
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Ein Kampf um die Zukunft bricht aus: Eine Bande gefährlicher Rumtreiber ist hinter Cole und Ramse her und gefährdet die Mission, die Vergangenheit zu retten.
Das Nachtzimmer
Staffel 1, Folge 5 FSK16
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Cole und Dr. Railly legen sich mit der „Armee der 12 Monkeys“ an und entdecken ein geheimes Labor, in dem das Virus aufbewahrt wird, das einmal die Menschheit ausrotten soll.
Roter Wald
Staffel 1, Folge 6 FSK16
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Die tragischen Ereignisse in dem geheimen Labor haben die Zukunft des Jahres 2043 verändert. Cole riskiert seine eigene Zukunft, um Dr. Railly zu retten.
Operation Troja
Staffel 1, Folge 7 FSK16
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Cole, Railly und Aaron müssen etwas unternehmen, damit das Virus nicht als Biowaffe in Tschetschenien eingesetzt wird.
Rückschläge
Staffel 1, Folge 8 FSK16
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Der Antrieb der Zeitmaschine verliert Energie. Um Cole aus der Vergangenheit zurückzuholen, muss Jones ihre ehemaligen Kollegen, die die militärische Operation leiten, davon überzeugen, dass sich ihr Auftrag lohnen wird.
Treibende Kräfte
Staffel 1, Folge 9 FSK16
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Cole befindet sich im Jahr 2017, die Seuche ist auf ihrem Höhepunkt. Da sie keine Wahl hat, unternimmt Jones einen ungeheuerlichen Schritt, um die Energiequelle der Zeitmaschine zu ersetzen.
The White Dragon
Staffel 1, Folge 10 FSK16
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Ramse entscheidet sich dafür, alles zu tun, was nötig ist, um seine neue Familie zu beschützen. Cole muss nun alleine sehen, wie er klarkommt. Es kommt zu einer heftigen Auseinandersetzung.
1987
Staffel 1, Folge 11 FSK16
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Coles letzter Versuch, die „Armee der 12 Monkeys“ zu stoppen, führt ihn in das Tokio des Jahres 1987.
Das Paradoxon
Staffel 1, Folge 12 FSK16
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Die Belastungen der Zeitreisen sind zu viel für Cole, er droht zu sterben. Railly muss die Person finden, die ihn retten kann.
Ankunft der 12
Staffel 1, Folge 13 FSK16
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In der letzten Folge der Staffel kommt es zur endgültigen Konfrontation von Cole und Railly mit ihren größten Gegnern. Gleichzeitig steht alles, was Jones bisher erreicht hatte, auf der Kippe.