Tämä on tarina Ponyosta, pienestä meren tyttökalasta, joka tekee kaikkensa toteuttaakseen unelmansa. Ponyo on nimittäin rakastutunut viisivuotiaaseen poikaan nimeltä Sosuke ja haluaa elää maalla tämän kanssa. Tämä nyky-Japaniin sijoittuva tarina ystävyydestä ja rakkaudesta perustuu osittain Hans Christian Andersenin "Pieneen merenneitoon".