Nå utgitt i fantastisk HD, feirer denne utgaven 25 års jubileum av den originale mangaen. I år 2029 er verden blitt sammenkoblet av et stort elektronisk nettverk som gjennomsyrer alle aspekter av livet. Det samme nettverket blir også en slagmark for Tokyos Nasjonalt sikkerhetsstyrke, som har blitt anklaget for å gripe meg til mesterhackeren, kun kjent som marionettmesteren. Spearheading utredningen er Major Motoko Kusanagi, som - som mange i hennes avdeling - er en cyborgoffiser, langt sterkere enn hennes menneskelige utseende, vil foreslå. Dukkemesteren, som er i stand til å hacke menneskelige sinn, forlater et spor av ofre som er ranet av sine minner. Snart begynner Motoko å tenke på selve eksistensen: Er hun rent kunstig konstruksjon, eller er det mer? Hva er spøkelset? Er det hennes essens i sitt cybernetiske skall?